John est très souple, car il faisait plusieurs étirements quand il était jeune et surtout parce qu'il avait fait du Yoga pendant plusieurs années depuis qu'il avait arrêté la drogue en 1997. Il avait decidé de faire du Yoga après sa période sombre de 1992 à 1997, car il avait compris qu'il avait abusé de drogue et descendu très bas et qu'il fallait se rattraper et être en paix avec le monde et devenir plus créatif en pratiquant du Yoga.
''Quand je parle à propos du fait de purifier moi-même, le Yoga est la manière principale de le faire. Tous les autres manières viennent seulement après celle-ci...Quand tu te reveilles et tu pratique du Yoga pendant la moitié de la journée, chaque jour, tu te rend compte que l'autre moitié de la journée a beaucoup moins d'importance, elle peut parfois te faire sentir tendu.''(John Frusciante)
Maintenant John ne pratique plus le Yoga. Il sort courrir dehors, car il trouve ça plus de sa nature.